Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 TOB1-201ENST00000268957 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD49-201ENST00000302755 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM173B-207ENST00000511437 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 USP6NL-206ENST00000609853 1748 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPA14-202ENST00000437161 1689 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 CTLA4-202ENST00000302823 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 RPLP1-201ENST00000260379 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 CLNS1A-201ENST00000263309 1172 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 IL37-201ENST00000263326 772 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 IL37-202ENST00000311328 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005342.1-201ENST00000354425 629 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 IL32-204ENST00000396887 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008770.1-201ENST00000406892 1257 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AL024497.1-201ENST00000412954 631 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 DEPDC4-203ENST00000416321 1155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AC074033.1-201ENST00000418623 410 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005301.1-201ENST00000423580 875 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP5G1P5-201ENST00000429024 411 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00945-201ENST00000453716 753 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 DTNBP1-204ENST00000462989 1010 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL17P37-201ENST00000490729 548 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL34-204ENST00000502534 560 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM138D-201ENST00000504074 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AC094104.2-201ENST00000509718 622 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087855.2-201ENST00000518217 537 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 FLJ46284-203ENST00000521230 407 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 CLNS1A-202ENST00000525064 1121 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 OR7E14P-201ENST00000526721 1000 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00678-202ENST00000534757 798 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 LMO3-211ENST00000534946 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AL359397.2-201ENST00000555403 446 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP6V1D-210ENST00000555474 1102 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AC127459.2-201ENST00000567395 932 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 COX10-AS1-203ENST00000577798 936 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AL512631.1-201ENST00000604086 840 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AL592504.1-201ENST00000605319 439 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.135-201ENST00000616324 269 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 CR381653.1-205ENST00000623409 580 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AP006248.4-201ENST00000624433 688 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms