Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS1Q99742 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms