Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms