Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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UBE2E2Q96LR5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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UBE2E2Q96LR5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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UBE2E2Q96LR5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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UBE2E2Q96LR5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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UBE2E2Q96LR5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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UBE2E2Q96LR5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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UBE2E2Q96LR5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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UBE2E2Q96LR5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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UBE2E2Q96LR5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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UBE2E2Q96LR5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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UBE2E2Q96LR5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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