Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms