Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms