Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms