Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP4Q96EB1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms