Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms