Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms