Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms