Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMGNT2Q8NAT1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms