Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYT2Q8N9I0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms