Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms