Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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