Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms