Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OPN5Q6U736 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms