Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms