Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC9A4Q6AI14 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms