Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BROXQ5VW32 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms