Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms