Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms