Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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