Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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