Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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