Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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