Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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