Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms