Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
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TRADDQ15628 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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TRADDQ15628 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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