Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms