Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SEC23BQ15437 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SEC23BQ15437 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SEC23BQ15437 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SEC23BQ15437 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SEC23BQ15437 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SEC23BQ15437 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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