Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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BRD3Q15059 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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BRD3Q15059 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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BRD3Q15059 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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BRD3Q15059 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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BRD3Q15059 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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BRD3Q15059 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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