Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms