Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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COL19A1Q14993 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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COL19A1Q14993 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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COL19A1Q14993 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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COL19A1Q14993 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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COL19A1Q14993 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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COL19A1Q14993 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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