Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms