Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms