Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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RFTN1Q14699 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
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RFTN1Q14699 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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RFTN1Q14699 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
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