Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms