Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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