Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MTMR3Q13615 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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