Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms