Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPM6BQ13491 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms