Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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