Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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