Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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