Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP140Q13342 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms