Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms