Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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