Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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