Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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